Модификационная станция (Modification Station) — расширенная станция изготовления. Служит для улучшения снаряжения и инструментов игрока, а также для усиления модулейЦиклопа и Мотылька. Может быть построена как на Циклопе, так и на морских базах.
В то время, как обычный изготовитель способен на атомарном уровне перестроить сырьё в сложные устройства, модификационная станция способна объединить сложные устройства для повышения их функциональности. Большинство промышленных кораблей оснащены оборудованным комплексом модификационной станции, которая позволяет инженерам адаптировать свои инструменты на лету.
По умолчанию, для экономии места на жёстком диске, модификационная станция исключена из большинства библиотек чертежей; тем не менее, в экстремальных условиях, таких как на океанической и пустынной планетах, может понадобиться адаптация основных инструментов для выживания для непредвиденного использования. По это причине рекомендуется всегда иметь доступ к модификационной станции.